El profesor Juan Peña coordina un grupo de trabajo en educación transformadora e inclusiva, con el proposito de avanzar hacia una educación más innovadora, inclusiva y orientada a la transformación social en el ámbito de las ciencias experimentales. Para ello, el grupo organiza talleres, seminarios, y lleva a cabo proyectos educativos en sinergía con con organizaciones comunitarias, asociaciones, y otros grupos de investigación para fortalecer la dimensión social del aprendizaje de los futuros docentes.