El Máster en Biotecnología Industrial y Ambiental tiene una organización modular de 90 créditos ECTS distribuidos en materias que se imparten semestralmente con una secuencia lógica: formación fundamental - formación especializada – formación práctica/profesional, y que comprende dos perfiles formativos: industrial y ambiental. Independientemente de estos perfiles el título se oferta con dos orientaciones: investigadora y profesional. Ambos aspectos responden a las necesidades de flexibilidad curricular deseable en un programa de Máster. Organizativamente se articula en módulos. Las actividades formativas de los distintos módulos se corresponden adecuadamente con la carga de trabajo requerida al alumno y con las competencias propuestas en cada caso.

Módulo fundamental de 36 créditos obligatorios distribuidos en 5 materias, tres de ellas se cursaran en el primer semestre (o tercero si se cursa a tiempo parcial) y dos en el segundo (o cuarto si se cursa a tiempo parcial).

Módulo optativo, de 48 créditos distribuido en 3 bloques: módulo optativo común, módulo optativo industrial y módulo optativo ambiental, de los que el alumno cursará 24 créditos durante el primer y segundo semestre o tercero y cuarto si se cursa a tiempo parcial. En los módulos industrial y ambiental se ofertan 18 créditos en cada uno, y en el módulo común a los dos perfiles formativos se ofertan 12 créditos más, para que el alumno además de elegir itinerario tiene la posibilidad de diseñar su perfil curricular.

El plan de estudios también incluye prácticas en empresas o en OPIs (15 créditos).

Los alumnos completaran su formación con la realización de un Trabajo Fin de Máster (TFM) de 15 créditos que podrá realizarse tanto en una empresa de base biotecnológica con actividad en I+D+i, o grupo de investigación de un OPI o de la UCM.