En nuestro grupo de investigación estamos interesados en el estudio de la interacción microorganismo - hospedador desde la perspectiva de la Proteómica. En particular, utilizamos como modelo de estudio el hongo patógeno oportunista Candida albicans y la candidiasis, con el objetivo de conocer mejor los mecanismos moleculares implicados en la virulencia e infección por parte del hongo y  en la respuesta inmune adaptativa e innata por parte del hospedador. Entre nuestros objetivos está la búsqueda de nuevos candidatos biomarcadores y vacunas para la candidiasis invasiva, pero además, desde el punto de vista del hospedador, estudiamos la activación de rutas de señalización en células inmunes que interaccionan con Candida.

Utilizamos Proteómica de alto rendimiento, o shotgun para adquirir una visión global del proteoma de células de Candida  en interacción con su hospedador. Fijando un objetivo más concreto, podemos elegir un conjunto de proteínas de interés, que podemos estudiar mediante Proteómica Dirigida , basada en la técnica Selected Reaction Monitoring (SRM), lo que permite la validación y cuantificación del conjunto de proteínas seleccionado con una alta reproducibilidad y sensibilidad. El uso combinado de ambas aproximaciones, es de gran utilidad para el estudio de nuestro modelo de interacción patógeno - hospedador.

En nuestra investigación estudiamos proteomas particulares de gran interés clínico.  En este sentido nos interesa estudiar el perfil fosfoproteómico de la activación inmune en el hospedador; también el surfoma (el conjunto de proteinas presentes en la superficie del hongo que contactan con el hospedador en primer lugar); el proteoma de vesículas de secreción, y también las proteínas de apoptosis con una gran potencial interés clínico.

Además estamos implicados en el Proyecto Proteoma Humano en el que desarrollamos en colaboración con otros grupos en España, métodos SRM para detectar proteínas codificadas en el cromosma 16 (chromosome-centric HPP, or C-HPP). Paralelamente, integramos la metodología adquirida con la rama Biology/Disease del HPP (B/D-HPP) estudiando proteínas de interés en la respuesta inmune en las candidiasis y micosis en general.