El Departamento cuenta con dos laboratorios de química geológica, situados en las plantas séptima y octava del edificio. El de la octava planta tiene como finalidad el desarrollo de las clases prácticas de la asignatura de Técnicas Instrumentales Geoquímicas, y del que se habla más detalladamente en el apartado de Aulas y laboratorios de alumnos.

Ambos laboratorios cuentan con abundante material fungible (material de vidrio y plástico, crisoles de platino, plata y teflón, etc.) e instrumental para llevar a cabo las rutinas analíticas para la determinación cuantitativa de elementos mayores y menores de materiales geológicos. Cuenta con tres campanas extractoras (dos en la octava y uno en la séptima), equipamiento de trabajao (baños de arena, epirradiadores, placas calentadoras, y otros), y los reactivos necesarios para el desarrollo de los estudios.

El equipamiento analítico de ambos laboratorios consta de lo siguiente:

- Un Espectrofotocolorímetro Carl Zeiss Elko-m 28671 () (se pueden analizar P2O5, SiO2, Fe2O3, MnO y TiO2).

- Un Fotómetro de Llama modelo Eppendorf Geratebau () (se pueden analizar: Ca, Mg, K, Na, Li y Ba).

- Un Espectrómetro de Absorción Atómica Instrumentation Laboratory AA/AE Spectrophotometer 951 () (se pueden analizar tantos elementos como lámparas de cátodo hueco, por ejemplo: Mn, Ca, Mg, K, Na, Ba, Sr, Mo, etc.).

- 2 Hornos mufla: uno de Heron, (hasta 1000ºC) para llevar a cabo procesos de calcinación y fusión de muestras.

- Varias estufas modelo Heraeus de hasta 150ºC.

- 3 Bi-destiladores.

- 4 Balanzas de precisión: una Mettler H20 T (), dos Sartorius () y una digital Mettler AT261.

- 1 granatario Sartorius.

Existe asimismo el material fungible necesario para realizar volumetrías (permanganometría para el FeO, complexometría para el Al2O3).

Asimismo, el Departamento cuenta con una pequeña exposición de diferentes equipos analíticos, alguno del siglo XIX, como el Colorimetro de Duboscq. Para más información, le recomendamos que visite el apartado de Equipos analíticos de Geoquímica de la sección Museos y colecciones del Departamento.