El Programa de Doctorado en Geografía se integra en la Estrategia de I+D+i de la Universidad Complutense de Madrid, para lo cual la Universidad Complutense tiene suscritos numerosos convenios institucionales con universidades españolas y de todo el mundo. En concreto el número de convenios de colaboración con universidades extranjeras alcanza el número de 150 y en todos ellos se contempla el intercambio de profesores, el desarrollo de proyectos de investigación conjuntos y la organización coordinada de cursos y seminarios, así como el intercambio de estudiantes de todos los ciclos. Igualmente la Facultad de Geografía e Historia de la UCM ha establecido y tiene en vigor convenios de movilidad con varias decenas de instituciones universitarias europeas, un importante número de las cuales tiene entre sus objetivos principales la colaboración el desarrollo de los estudios de Geografía.

Apoyándose en este marco, los programas de doctorado desarrollados por los Departamentos de Análisis Geográfico Regional y Geografía Física y de Geografía Humana han establecido a lo largo de su trayectoria relaciones de colaboración con buen número de universidades, instituciones públicas de investigación y organismos de rango nacional e internacional. Dichas relaciones de colaboración -centradas genéricamente en el intercambio académico de investigadores y alumnos de postgrado, en las estancias para participar en cursos y seminarios y en la codirección y la participación en tribunales de tesis doctorales- mantienen su vigencia y se han prolongado (o incluso ampliado) para asegurar su calidad e incrementar la capacidad formativa en el nuevo Programa de Doctorado en Geografía.

Entre las instituciones que han colaborado con los programas anteriores y van a seguir colaborando en este programa se pueden destacar las siguientes: Centro Nacional de Información Geográfica. Instituto Geográfico Nacional (IGN). Madrid; Instituto de Ciencias Medioambientales. Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC). Madrid; Instituto Pirenaico de Ecología. Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Zaragoza; -Centro de Investigaciones Forestales (CIFOR). Instituto Nacional de Investigaciones Agrarias (INIA). Madrid;  Departamento de Geografía. Universidad de Alcalá de Henares. Alcalá de Henares (Madrid); Instituto de Economía, Geografía y Demografía. CSIC; Centro de Investigación del Transporte (Transyt). Universidad Politécnica de Madrid (UPM; Departamento de Análisis Económico. Universidad Autónoma de Madrid; Departamento de Análisis Económico Aplicado. Universidad de Las Palmas de Gran Canaria; Faculdade de Letras. Universidade de Lisboa (Portugal); Departamentos de Geografía. Universidade do Minho (Portugal); Laboratório de Urbanismo, Ordenamento do Território e Transportes. Universidade do Coimbra (Portugal); Centro de Ecologia Aplicada “Profesor Baeta Neves”; Instituto de Geografía. Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM). México DF; Centro de Geociencias. Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM); Departamento de Ecología Humana. Centro de Investigaciones y Estudios Avanzados (CINVESTAV). Instituto Politécnico Nacional de México. Mérida (México); División de Ciencias Económico Administrativas. Universidad de Guanajuato (México); Departamento de Geografía y Ordenación Territorial. Universidad de Guadalajara, Jalisco (México; Departamento de Geografía. Universidad de la Plata (Argentina) ; Departamento de Geografía. Facultad de Humanidades. Universidad Nacional del Nordeste (UNNE), Resistencia (Chaco, República Argentina); National Center for Geographic Information and Analysis (NCGIA). Universidad de Buffalo. Buffalo USA; Asociación Universitaria Iberoamericana de Postgrado(AUIP) – Sistema de Universidades Estatales del Caribe Colombiano, Cartagena de Indias (Colombia); National Center for Geographic Information and Analysis (NCGIA). Universidad de Buffalo. Buffalo USA.  

Todos estos convenios y otros que están en vías de realización tienen como objeto favorecer la captación de estudiantes de doctorado y las estancias de formación de los doctorandos en centros de investigación nacionales y extranjeros, así como la movilidad del profesorado. Las colaboraciones en el Programa de doctorado de profesores externos de prestigio, tanto del ámbito nacional como internacional, que acrediten su calidad y excelencia, se posibilita en la medida de lo posible mediante la obtención de financiación de instituciones públicas y privadas. A dicha financiación se unen fondos pertenecientes a las ayudas que puedan obtener los grupos y proyectos de investigación participantes en el Programa, el cual se acoge a las convocatorias que posibilitan la movilidad del profesorado universitario, entre las que se pueden citar: Ayudas de Movilidad del profesorado (MEC), Programa Erasmus TS (Docente), Convenios de cotutela de tesis doctorales, Estancias de investigadores en régimen de sabático en España, Programas de cooperación interuniversitaria.

Además de los convenios o colaboraciones que pueda establecer el Programa de doctorado en el futuro, los equipos de investigación del programa cuentan con especialistas de reconocido prestigio, tanto en el ámbito nacional como internacional, lo que favorece la realización de codirecciones o co-tutelas de tesis doctorales, así como de las tesis con mención Internacional, con las correspondientes estancias de los doctorandos en otros centros.