Los temas de investigación y de formación de investigación se estructuran en: a) primeros poblamientos (Paleolítico inferior), b) expansión del poblamiento (Paleolítico medio y superior), c) transición a la actualidad climática (Epipaleolítico-Mesolítico), d) primeros grupos productores (Neolítico y Calcolítico), e) sociedades complejas y urbanismo (Edad del Bronce y Edad del Hierro); y f) pueblos prerromanos y colonizadores (Protohistoria). 

Desde un punto de vista temático se trabaja en: a) reconocimiento de secuencias estratigráficas, b) reconstrucción paleoambiental, económica y paleoetnográfica, c) realización de analíticas arqueométricas, d) reconstrucción de secuencias culturales, y e) reconocimiento de la movilidad y redes de poblamiento. Comprende los siguientes contenidos: a) definición de soportes geocronológicos incluyendo dataciones numéricas; b) diagnóstico arqueo-estratigráfico; c) estudio de tecno-complejos líticos, óseos, cerámicos y metálicos (materia prima, tecnológica, tipológica y traceologia); d) análisis arqueo-paleontológico: reconstrucción tafonómica, paleoambiental y paleoeconómica; e) estudios antropológicos y etnológicos; f) estudios de comportamientos simbólicos (ornamentos, arte, enterramientos, etc.); g) estudios de ordenación del paisaje y del poblamiento, con incidencia sobre el urbanismo, la arquitectura y la expansión comercial-territorial; y h) gestión