LABORATORIO DE RETROVIRUS
Laboratorio de Retrovirus
Laboratory of Retroviruses
- LINEAS DE INVESTIGACION
- RESEARCH LINES
- MIEMBROS DEL GRUPO/GROUP MEMBERS
- PUBLICACIONES/PUBLICATIONS
- PROYECTOS/FUNDING
- INFORMACION DE CONTACTO/CONTACT INFORMATION
Líneas de investigación y resumen de investigación
El laboratorio de retrovirus es un grupo emergente dentro del departamento de Bioquímica y Biología Molecular en la sección de Facultad de Farmacia de la Universidad Complutense de Madrid. Nuestras principales líneas de investigación son:
- Inmunopatología y Biología Molecular y Celular de la infección por VIH
- Interacciones Virus-célula
- Factores de restricción
El principal interés del laboratorio es el estudio de los eventos tempranos posteriores a la entrada en la célula en la infección por el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) con el objetivo de comprender los mecanismos de patogénesis del VIH e identificar potenciales dianas terapéuticas que permitan el control y/o la erradicación del virus.
El VIH tiene un tropismo de especie muy limitado, debido principalmente a dos tipos de factores celulares: 1) factores que son necesarios para la replicación del VIH pero que exhiben cambios específicos de especie que no permiten un uso eficiente por parte del virus; y 2) factores de restricción que bloquean la replicación en muchas especies. Estos factores de restricción son proteínas celulares que bloquean directamente determinadas etapas del ciclo de replicación viral de una manera específica de especie. Estos factores de restricción constituyen una parte de nuestro sistema inmune innato, comúnmente conocido como inmunidad intrínseca, y son la primera línea de defensa contra las infecciones virales. Su actividad antiviral puede ser contrarrestada por proteínas virales, lo que requiere adaptaciones durante los saltos de especies.
Se han descrito numerosos factores de restricción que bloquean la infección por VIH en diferentes etapas del ciclo de replicación, incluidos APOBEC3G, TRIM5α, BST-2, SAMHD1, MX2 y SERINC5. Diversas líneas de investigación, incluida la nuestra, sugieren la existencia de factores de restricción adicionales que bloquean la replicación del VIH y otros lentivirus. Nuestro laboratorio se centra en la identificación y caracterización de nuevos factores de restricción frente al VIH y otros retrovirus.
Estos estudios pretenden ayudar a mejorar nuestra comprensión de la infección y patogénesis en humanos, y entender mejor los mecanismos que utiliza el VIH para escapar al sistema inmune innato. Estos estudios también pueden contribuir a encontrar nuevas dianas terapéuticas antivirales y marcadores de prognosis. Además, tienen relevancia para el desarrollo de nuevos modelos animales de investigación en el campo de VIH.
Research lines and overview of research
The laboratory of retroviruses is an emerging group in the department of Biochemistry and Molecular Biology in the section of the School of Pharmacy at the Complutense University of Madrid. Our main research lines are:
- Immunopathology and Molecular and Cell Biology of HIV infection
- Virus-cell interactions
- Restriction factors
The main interest of the laboratory is the study of the early post entry events of human immunodeficiency virus (HIV) infection with the aim of understand the mechanisms of HIV pathogenesis and to identify potential targets for viral control and/or eradication.
HIV has a narrow species tropism, mainly due to two types of host factors: 1) factors that are required for HIV replication but exhibit species-specific changes that do not allow efficient use by HIV; and 2) restriction factors that block replication in many species. These restriction factors are host cellular proteins that directly block certain steps of the viral life cycle in a species-specific way. They are a part of our innate immune system, commonly known as intrinsic immunity, and constitute the first line of defense against viral infections. Their antiviral activity can be counteracted by viral proteins, requiring adaptations during species jumps.
Several restriction factors that block HIV infection at different steps of the replication cycle have been described, including APOBEC3G, TRIM5α, BST-2, SAMHD1, MX2 and SERINC5. Several lines of evidence, including ours, suggest the existence of additional restriction factors that block replication of HIV and other lentiviruses. Our laboratory focusses on the identification and characterization of novel restriction factors that block replication of HIV and other retroviruses.
These studies are aimed to improve our understanding of HIV infection and the pathogenesis in humans, and better understand the mechanisms that HIV uses to escape the innate immune system. In addition, these studies can contribute to find new antiviral therapeutic targets that could allow either the control or the eradication of the virus and new prognosis markers. They are also relevant for the development of new animal models for HIV research.
Miembros del grupo / Group members
Investigadora principal /Principal investigator:
Dr. Beatriz Pacheco González, PhD (Profesora Contratada Doctora / Associate professor)
Estudiantes / Students:
Paula Verneuil Carnerero (estudiante de máster / MSc. student)
Enrique Juliá Arevalo (estudiante de grado en Bioquímica / BSc. in Biochemistry student)
Miembros anteriores del grupo /Former group members
María Torres Hidalgo (Investigadora contratada programa Investigo CAM / Researcher of the Investigo program of CAM. 2022-23)
Estudiantes / Students:
Miguel Tenorio Mollá (estudiante de máster / MSc. Student, 2022-23)
Paula Andrea Leoro Garzón (estudiante de máster / MSc. Student, 2021-22)
Ignacio Álvarez Calles (estudiante de grado en Bioquímica / BSc. in Biochemistry student, 2021-22)
María Torres Hidalgo (estudiante de máster / MSc. Student, 2021)
Alberto Fernández Oliva (estudiante de máster / MSc. Student, 2013-14)
Publicaciones seleccionadas / Selected publications
http://orcid.org/0000-0003-0057-1973
Castillo-Menendez LR, Witt K, Espy N, Princiotto A, Madani N, Pacheco B, Finzi A, Sodroski J.
J Virol. 2018 May 29;92(12):e00277-18. doi: 10.1128/JVI.00277-18. Print 2018 Jun 15. PMID: 29618643
Prévost J, Richard J, Ding S, Pacheco B, Charlebois R, Hahn BH, Kaufmann DE, Finzi A.
Virology. 2018 Feb;515:38-45. doi: 10.1016/j.virol.2017.12.002. Epub 2017 Dec 15. PMID: 29248757
Adaptation of HIV-1 to cells with low expression of the CCR5 coreceptor.
Espy N, Pacheco B, Sodroski J.
Virology. 2017 Aug;508:90-107. doi: 10.1016/j.virol.2017.04.033. Epub 2017 May 15. PMID: 28521215
Prévost J, Zoubchenok D, Richard J, Veillette M, Pacheco B, Coutu M, Brassard N, Parsons MS, Ruxrungtham K, Bunupuradah T, Tovanabutra S, Hwang KK, Moody MA, Haynes BF, Bonsignori M, Sodroski J, Kaufmann DE, Shaw GM, Chenine AL, Finzi A.
J Virol. 2017 Mar 13;91(7):e02452-16. doi: 10.1128/JVI.02452-16. Print 2017 Apr 1. PMID: 28100618
Pacheco B, Alsahafi N, Debbeche O, Prévost J, Ding S, Chapleau JP, Herschhorn A, Madani N, Princiotto A, Melillo B, Gu C, Zeng X, Mao Y, Smith AB 3rd, Sodroski J, Finzi A.
J Virol. 2017 Feb 14;91(5):e02219-16. doi: 10.1128/JVI.02219-16. Print 2017 Mar 1. PMID: 28003492
Characterization of two distinct early post-entry blocks to HIV-1 in common marmoset lymphocytes.
Pacheco B, Menéndez-Arias L, Sodroski J.
Sci Rep. 2016 Nov 23;6:37489. doi: 10.1038/srep37489. PMID: 27876849
Richard J, Pacheco B, Gohain N, Veillette M, Ding S, Alsahafi N, Tolbert WD, Prévost J, Chapleau JP, Coutu M, Jia M, Brassard N, Park J, Courter JR, Melillo B, Martin L, Tremblay C, Hahn BH, Kaufmann DE, Wu X, Smith AB 3rd, Sodroski J, Pazgier M, Finzi A.
EBioMedicine. 2016 Oct;12:208-218. doi: 10.1016/j.ebiom.2016.09.004. Epub 2016 Sep 9. PMID: 27633463
A Highly Conserved gp120 Inner Domain Residue Modulates Env Conformation and Trimer Stability.
Ding S, Tolbert WD, Prévost J, Pacheco B, Coutu M, Debbeche O, Xiang SH, Pazgier M, Finzi A.
J Virol. 2016 Sep 12;90(19):8395-409. doi: 10.1128/JVI.01068-16. Print 2016 Oct 1. PMID: 27384653
HIV-1 Adapts To Replicate in Cells Expressing Common Marmoset APOBEC3G and BST2.
Fernández-Oliva A, Finzi A, Haim H, Menéndez-Arias L, Sodroski J, Pacheco B.
J Virol. 2015 Oct 28;90(2):725-40. doi: 10.1128/JVI.02431-15. Print 2016 Jan 15. PMID: 26512082
Haim H, Salas I, McGee K, Eichelberger N, Winter E, Pacheco B, Sodroski J.
Cell Host Microbe. 2013 Nov 13;14(5):547-58. doi: 10.1016/j.chom.2013.10.006. PMID: 24237700
Virus-specific effects of TRIM5α(rh) RING domain functions on restriction of retroviruses.
Li X, Kim J, Song B, Finzi A, Pacheco B, Sodroski J.
J Virol. 2013 Jul;87(13):7234-45. doi: 10.1128/JVI.00620-13. Epub 2013 May 1. PMID: 23637418
Xiang SH, Pacheco B, Bowder D, Yuan W, Sodroski J.
Virology. 2013 Mar 30;438(1):5-13. doi: 10.1016/j.virol.2013.01.002. Epub 2013 Jan 29. PMID: 23369572
The HIV-1 gp120 major variable regions modulate cold inactivation.
Medjahed H, Pacheco B, Désormeaux A, Sodroski J, Finzi A.
J Virol. 2013 Apr;87(7):4103-11. doi: 10.1128/JVI.03124-12. Epub 2013 Jan 23. PMID: 23345516
Désormeaux A, Coutu M, Medjahed H, Pacheco B, Herschhorn A, Gu C, Xiang SH, Mao Y, Sodroski J, Finzi A.
J Virol. 2013 Mar;87(5):2549-62. doi: 10.1128/JVI.03104-12. Epub 2012 Dec 19. PMID: 23255784
Finzi A, Pacheco B, Xiang SH, Pancera M, Herschhorn A, Wang L, Zeng X, Desormeaux A, Kwong PD, Sodroski J.
J Virol. 2012 Sep;86(17):8974-86. doi: 10.1128/JVI.01076-12. Epub 2012 Jun 13. PMID: 22696649
Haim H, Strack B, Kassa A, Madani N, Wang L, Courter JR, Princiotto A, McGee K, Pacheco B, Seaman MS, Smith AB 3rd, Sodroski J.
PLoS Pathog. 2011 Jun;7(6):e1002101. doi: 10.1371/journal.ppat.1002101. Epub 2011 Jun 23. PMID: 21731494
Zhukovsky MA, Basmaciogullari S, Pacheco B, Wang L, Madani N, Haim H, Sodroski J.
PLoS One. 2010 Oct 13;5(10):e13249. doi: 10.1371/journal.pone.0013249. PMID: 20967243
Adaptation of HIV-1 to cells expressing rhesus monkey TRIM5α.
Pacheco B, Finzi A, Stremlau M, Sodroski J.
Virology. 2010 Dec 20;408(2):204-12. doi: 10.1016/j.virol.2010.09.019. Epub 2010 Oct 16. PMID: 20956011
Finzi A, Pacheco B, Zeng X, Kwon YD, Kwong PD, Sodroski J.
J Virol Methods. 2010 Sep;168(1-2):155-61. doi: 10.1016/j.jviromet.2010.05.008. Epub 2010 May 13. PMID: 20471426
Finzi A, Xiang SH, Pacheco B, Wang L, Haight J, Kassa A, Danek B, Pancera M, Kwong PD, Sodroski J.
Mol Cell. 2010 Mar 12;37(5):656-67. doi: 10.1016/j.molcel.2010.02.012. PMID: 20227370
Pacheco B, Finzi A, McGee-Estrada K, Sodroski J.
J Virol. 2010 Apr;84(8):4095-9. doi: 10.1128/JVI.02631-09. Epub 2010 Feb 3. PMID: 20130055
Xiang SH, Finzi A, Pacheco B, Alexander K, Yuan W, Rizzuto C, Huang CC, Kwong PD, Sodroski J.
J Virol. 2010 Apr;84(7):3147-61. doi: 10.1128/JVI.02587-09. Epub 2010 Jan 20. PMID: 20089638
Stevceva L, Yoon V, Carville A, Pacheco B, Santosuosso M, Korioth-Schmitz B, Mansfield K, Poznansky MC.
J Immunol. 2008 Oct 15;181(8):5510-21. doi: 10.4049/jimmunol.181.8.5510. PMID: 18832708
Pacheco B, Basmaciogullari S, Labonte JA, Xiang SH, Sodroski J.
J Virol. 2008 Jan;82(1):346-57. doi: 10.1128/JVI.01299-07. Epub 2007 Oct 24. PMID: 17959679
Basmaciogullari S, Pacheco B, Bour S, Sodroski J.
Virology. 2006 Sep 15;353(1):52-67. doi: 10.1016/j.virol.2006.05.027. Epub 2006 Jun 30. PMID: 16808956
Proyectos de investigación financiados / Project funding
Descubrimiento de nuevos factores antirretrovirales y sus mecanismos de acción.
Universidad Complutense de Madrid (PR3/23-30836).
15 noviembre 2023 - 14 noviembre 2024
Investigador principal/Principal investigator: Beatriz Pacheco.
Descubrimiento de nuevos factores antirretrovirales y sus mecanismos de acción.
Banco Santander/Universidad Complutense de Madrid (PR108/20-19).
12 abril 2021 - 11 abril 2022
IP / PI: Beatriz Pacheco.
Innate intracellular blocks to HIV-1 in New World monkeys.
European Commission 7th Framework Program for Research and Technological Development. Marie Curie Career Integration Grant. (Proposal acronym HIVMARMOD, proposal number 332623).
1 enero 2013 - 31 diciembre 2015
IP / PI: Beatriz Pacheco.
Overcoming the innate intracellular blocks to HIV-1 in New World monkeys
Harvard University Center for AIDS Research (CFAR), a National Institutes of Health funded program (P30 AI060354).
Duración: 13 octubre 2010 - 12 octubre 2011
IP / PI: Beatriz Pacheco.
Información de contacto / Contact information
Departamento de Bioquímica y Biología Molecular / Department of Biochemistry and Molecular Biology
Facultad de Farmacia / School of Pharmacy
Universidad Complutense de Madrid
Plaza Ramón y Cajal s/n
28040 Madrid
España (Spain)
Tel.: (+34) 91 394 1853
e-mail: b.pacheco@ucm.es