Francisco Hernández Sánchez se doctoró en 1976 en Ciencias Químicas por la Universidad Complutense de Madrid, y solo un año más tarde comenzó su carrera como profesor titular en el departamento de Biología Molecular de la Universidad Autónoma de Madrid hasta 2010. Durante estos años participó en quince proyectos de investigación y acreditó cuatro sexenios de investigación.      

En el campo de la Historia del Arte es licenciado por la Universidad Autónoma de Madrid (2009) y, en el mismo centro, estudió un Máster en Estudios Medievales Hispánicos (2012). Su tesis doctoral fue defendida en 2016 bajo la dirección del Dr. Juan Carlos Ruiz Souza, con quien investiga sobre las artes suntuarias de la Baja Edad Media en al-Andalus y Castilla, tema sobre el cual ha publicado en la reconocida revista de investigación Goya.